A Kolozsvári Magyar Szakkollégiumi Központ létrehozását célzó program két részből áll: egyrészt a szükséges infrastruktúra megteremtése, másrészt az oktatási és kutatási programok megszervezése. Ez utóbbi a szakkollégiumi oktatást, a tutoriális programok és a speciális képzési formák működtetését jelenti.
A 2004/2005-ös egyetemi évben az oktatási és kutatási programok megszervezése, beindítása volt a cél. Ennek megfelelően 14 szakterületet (biológia– ökológia geológia, filozófia, irodalomtudomány, jogtudomány, közgazdaságtudomány, matematika–informatika, művészettörténet, néprajz, politológia, régészet, szociológia) lefedő 11 szakkollégium kezdte el működését.
A 2005/2006 évben ez 16, a 2006/2007-es tanévben 19, a 2007/2008-es tanévben 21, illetve a 2008/2009-es tanévben 22 szakkollégiumra bővült. Jelenleg pedig, a BBTE és a KMEI tagszervezeteinek hálózatában a következő szakkollégiumok működnek:
A KMEI Szakkollégium programjában szereplő szakkollégiumok:
- Alkalmazott-didaktika Szakkollégium – Pszichológia és Neveléstudományok Kar
- Apáthy István Szakkollégium – Biológia és Geológia Kar, biológia és ökológia szakok
- Balogh Artúr Szakkollégium – Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Kar
- Cholnoky Jenő Földrajz Szakkollégium – Földrajz Kar; honlap: www.cholnoky.ro
- Entz Géza Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
- Erdélyi Római Katolikus Státus Szakkollégium – Római Katolikus Teológiai Kar
- Farkas Gyula Szakkollégium – Matematika és Informatika Kar; honlap: www.cs.ubbcluj.ro/»bittologatok
- Fizika Szakkollégium – Fizika Kar; honlap: atom.ubbcluj.ro/szakkoll
- Julesz Társaság – Képzőművészeti Egyetem
- Kémia Szakkollégium – Kémia és Vegyészmérnöki Kar
- Közgazdasági Kutató Klub – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
- Kriza János Szakkollégium – Bölcsészettudományi Kar
- Láthatatlan Kollégium – Bölcsészettudományi Kar
- MATUR Szakkollégium – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
- Márton Gyula Nyelvészeti Szakkollégium – Bölcsészettudományi Kar
- Max Weber Szociológiai Szakkollégium – Szociológia és Szociális Munkás Kar
- Menedzsment Szakkör – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
- Mikó Imre Jogi és Közgazdasági Szakkollégium – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar
- Pokoly József Szakkollégium – Református Tanárképző Kar
- Politikai Marketing Szakkollégium – Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi és Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Karok
- Pósta Béla Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
- Pro Philosophia Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar
- Spectator Média Szakkollégium – Politika-, Közigazgatás- és Kommunikációtudományi Kar
- Történelem Szakkollégium – Történelem és Filozófia Kar